有些化肥施用于蔬菜后，可以提高其品质与产量，但有些化肥施用于蔬菜后虽能提高产量，却会对蔬菜产生污染。
硝酸铵和其他硝态氮肥不宜施用于蔬菜。硝态氮肥施入菜田后，会使蔬菜中的硝酸盐含量成倍增加，硝酸盐在人体中容易被还原为亚硝酸盐，亚硝酸盐对人体会造成伤害。
氯化铵、氯化钾等含氮化肥，不宜施用于番茄、马铃薯等作物。含氮肥料在土壤中分解后，铵或钾离子会被土壤吸附或被蔬菜吸收，浓度达到一定程度时，会对蔬菜根系产生毒害，严重的会造成蔬菜死亡。
叶菜类蔬菜忌叶面喷施氮肥。叶面喷施氮肥，铵离子与空气接触后易转化为硝酸根离子被叶片吸收，因为叶菜类蔬菜生育期短，硝酸盐很容易在叶片内积累。因此，忌对叶菜类蔬菜叶面喷施氮肥。
此外，施用微肥莫随意，微肥能促进蔬菜优质高产，但蔬菜对微量元素的需求较少，过量施用微肥不仅会造成浪费，而且还会对植株产生毒害作用。
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